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Laboratoire de Yohan Bossé 

Le laboratoire du Dr Bossé est situé au centre de recherche de l’« Institut universitaire de cardiologie et de pneumologie de Québec (IUCPQ) », Québec, Canada. Le centre de recherche est relié à l’un des meilleurs hôpitaux traitant les patients souffrant de maladies cardiovasculaires et respiratoires au Canada. L’équipe dispose d’un laboratoire génétique complet et de ressources informatiques.

Laboratoire de génétique

 

Le laboratoire de génétique est équipé de tous les instruments et du matériel requis pour effectuer des travaux de biologie moléculaire. Le laboratoire est divisé en deux zones spécifiques, situées dans des immeubles connexes :

les zones Pré-PCR et Post-PCR.

 

Le laboratoire est équipé d’un système d’analyse génétique, le lecteur BeadXpress d’Illumina®. Il offre une grande diversité de fonctions et d’applications tels que les tests de variation génétique, d’expression de gène ou d’analyse de protéines en plus d’offrir la flexibilité nécessaire pour le développement de différents essais adaptés à chaque projet de recherche. L’instrument permet également de procéder à  des analyses dans un contexte de diagnostic moléculaire.

La zone Pré-PCR comprend :

 

  • Des centrifugeuses réfrigérées de petite et grande taille

  • Un homogénéisateur Bertin

  • Un spectrophotomètre UV visible Nanovue, GE Healthcare

  • Des congélateurs à -20 et -80 degrés Celsius

 

  

La zone Post-PCR comprend :

 

  • Un réfrigérateur à 4 degrés Celsius doté de doubles portes en verre

  • Un congélateur à -20 degrés Celsius

  • Une centrifugeuse réfrigérée à grande capacité

  • Une microcentrifugeuse

  • Deux thermocycleurs

  • Un système d’électrophorèse et d’analyse de protéines par immunotransfert

 

  

Les zones Pré et Post-PCR comprennent également :

 

  • Plusieurs paillasses et équipements tels que des pipettes de type manuelles ou électroniques, à simples ou multicanaux

  • Des agitateurs de type vortex

  • Des mini-centrifugeuses

  • Des agitateurs avec plaques chauffantes

  • Des blocs chauffants

  • Des bains d’eau

  • Un pH-mètre

  • Des balances

  

Une troisième zone du laboratoire est équipée de congélateurs à -80 et -30 degrés Celsius pour le stockage d’échantillons cliniques.

 

Les équipements communs sont  partagés entre les laboratoires, incluant :

 

  • Des systèmes de détection en temps réel pour PCR quantitatif CFX-96 et CFX-384 (Bio Rad)

  • Des lecteurs de micro-plaques (UV, visible et fluorescence)

  • Un système de photo-documentation

Ressources informatiques

 

L’équipe des technologies de l’information de l’IUCPQ gère le réseau ainsi que tous les ordinateurs. L’accès au réseau est protégé par des codes d’identification uniques attribués à chaque membre du personnel et par plusieurs systèmes pare-feu. Les données de tous les utilisateurs sont protégées par plusieurs programmes de sauvegarde.

Tous les bureaux sont équipés de PC ou d’ordinateurs Macintosh récents. Des serveurs Linux sont également disponibles pour traiter les données génomiques de haut débit et effectuer des analyses génétiques de petites et grandes envergures.

Pour les analyses à plus grande échelle, le laboratoire du Dr Bossé dispose d’un compte permettant l’accès à un superordinateur (Calcul Canada). Cette infrastructure de calcul est située sur le campus de l’Université Laval et est connectée par fibres optiques au réseau de l’IUCPQ, assurant ainsi le transfert efficace des données. Le serveur contient 7680 cœurs de calcul, ce qui est amplement suffisant pour les projets qui sont actuellement effectués au laboratoire.